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只看楼主正序阅读使用道具楼主发表于: 2023-08-13 16:22:49

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Spectronaut™ 近年来一直为DIA实验的数据分析提供最好的解决方案。而最新版本Spectronaut 将目前多个独立的DIA相关分析流程进行了无缝整合，更好的扩展了Spectronaut的应用领域。

Spectronaut®是一个旨在独立分析数据
获取（DIA）蛋白质组学实验。Spectronaut可以对数百到
数千种蛋白质。具有多种条件的大型实验
并且可以分析由多达数万次LC-MS运行组成的重复。
Spectronaut可以在不使用保留时间校准试剂盒的情况下分析DIA数据。然而
强烈建议添加iRT试剂盒，因为它可以确保在困难的矩阵上进行校准
并且允许详细的质量控制读数。

1. 构建混合库
通过组合其他来源的大规模谱图库(project 或 resource libraries)和样品本身DIA检测数据(directDIA)，可以不用自己建库便能得到较大量的定量蛋白数。
2. 加入标记的工作流程
在混合Biognosys全新PQ500同位素标肽试剂盒，目标蛋白可以通过非标定量的方式进行绝对定量且能够跨越5个数量级。
3. 宿主细胞蛋白
通过矫正残留蛋白，可以对低丰度的宿主细胞蛋白进行高精度的定性定量。
“Spectronaut X 在混合库建立过程中能够整合DDA和DIA数据，在我们的实践中发现可以得到更好的结果并以此开发全新的数据采集策略。”
新版本的核心是 Biognosys 的新型搜索引擎 Kuiper，由专门针对非特异性搜索优化的专有预测模型提供支持。Kuiper 提供破纪录的肽鉴定，特别是免疫肽组学应用。
Spectronaut 20 的主要特点：

免疫肽组学 HLA I 类工作流程中的肽鉴定增加多达 80%
使用 directDIA 运行时改进加速处理
通过离子淌度敏感算法提高 timsTOF 数据的定量准确性
扩展的 FDR 和质量控制选项
改进了数据可视化、Linux 支持和云兼容性
可在 Bruker ProteoScape 上使用，扩展其免疫肽组学和翻译后修饰分析的能力

Kuiper 还为 Biognosys 基于 DDA 的蛋白质组学最新版本 SpectroMine
5 提供支持，现在提供显著增强的鉴定性能。通过新增的 Linux 支持，SpectroMine 与 Spectronaut 一起在云和高性能计算（HPC）环境中实现高通量蛋白质组学数据分析，从而实现可扩展的下一代研究工作流程。